@surface

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====== 各種アプリケーション ======
よく使用するアプリケーションは、[[研究室の共有フォルダ]]におかれています。

[[MacOSX:インストール作業概要]]
===== Multi-Platform =====
  ; [[vesta|VESTA]]
  : 結晶構造、及び電子・核密度等の三次元可視化プログラム
  ; [[vmd|VMD]]
  : 結晶構造、及び電子・核密度等の三次元可視化プログラム
===== MacOSX =====
  ; [[mi|mi]]
  : みみかきエディタ。MacOSX用テキストエディタ。
  ; [[http://rbruehl.macbay.de/|Abscissa]]
  : 研究室標準2Dグラフ作成ツール。必ず使えるようになること。
  ; [[Cyberduck]]
  : 数値計算用ワークステーションとMacとの間のファイル転送を行う。
  ; [[計算機実習:imol]]
  : 分子構造可視化ツール。xyzファイルをダブルクリックすると起動する。（起動してしまう）
  ; [[http://plot.micw.eu/|Plot]]
  : 2Dグラフ作成ツール。複雑なカーブフィッティングやfftによる処理を行う。

===== Java =====
  * [[http://java.sun.com/javase/| Sun Java(TM) Runtime Environment (JRE) + Java(TM) Plug-in]]

  ; [[jmol]]
  : Javaベースの分子構造可視化ツール。ボンドの組み換えが起こるアニメーションはJmolでつくる。
  ; [[http://rsb.info.nih.gov/ij/|ImageJ]]
  : Javaベースの画像処理ツール。デンシティプロットの仕組みを把握しておくこと。
  ; [[http://samurai-graph.sourceforge.jp/index.html.ja|Samurai Graph]]
  : 2Dグラフ作成ツール。JavaベースなのでWindowsやLinuxでも使える。

===== X11 =====
  ; [[x11]]
  :
  ; [[計算機実習:molden]]
  : molden
  ; [[計算機実習:gnuplot]]
  : gnuplot
  ; [[rasmol]]
  : rasmol


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