@surface

この文書は読取専用です。文書のソースを閲覧することは可能ですが、変更はできません。もし変更したい場合は管理者に連絡してください。
====== 波動関数の描画 ======
===== 実習1 一酸化炭素の計算 =====
  * [[seminar:remote#coteditを使ってmac側にcopyを作成|前々回の実習]]を参考にCOの全エネルギー計算を実行する
    - 箱の大きさをちょっと大きめにする。
    - 計算する状態の個数をちょっと多めにする。
    - 出力ファイル名を指定して実行する<code text>
.
.
.
calc = Jacapo('tekitou_na_namae.nc', nbands = 8)
.
.
.
calc.Calculate()
</code>

===== 実習2 VESTA用ファイルの作成 =====
  - Dacapoの出力ncファイルから波動関数可視化のためのVESTA用ファイルを作成する((必ず最新のVESTA.appを使用すること))
  - 適当なディレクトリを作り、そこにncファイルをコピーする\\ ただし、バンド分散の計算に使ったncファイルは使わないこと。電子状態の数×波数の数だけの大量のファイルができるので注意。<code sh>
$
$ mkdir tekitou_na_directory
$ cp sakki_tukutta_file.nc tekitou_na_directory/
$
</code>
  - ncファイルをコピーしたディレクトリにcdで移動し、nc2cubeを動かす。<code sh>
$
$ cd tekitou_na_directory/
$ ls
sakki_tukutta_file.nc
$ nc2cube -a sakki_tukutta_file.nc sakki_tukutta_file.cube
GetWaveFunction: kpt =  [-0.375 -0.375  0.   ]
GetWaveFunction: kpt =  [-0.375 -0.125  0.   ]
...

$ ls
sakki_tukutta_filek0.cube  sakki_tukutta_filek1.cube  ab33504k2.cube  sakki_tukutta_filek3.cube  sakki_tukutta_filek4.cube 
...
</code>
  - できたcubeファイルをiMacに転送する。

===== 実習3 可視化 =====
  * 転送したcubeファイルをVESTA.appで可視化し、以下のような図を描け

==== 波動関数の断面 ====

{{:seminar:sigma1.png?100|}}
{{:seminar:sigma2.png?100|}}
{{:seminar:pi1.png?100|}}
{{:seminar:sigma3.png?100|}}
{{:seminar:pi2.png?100|}}
{{:seminar:sigma4.png?100|}}

==== 2つの面による断面 ====

{{:seminar:section1.png?200|}}
{{:seminar:section2.png?200|}}