http://sstweb.ee.ous.ac.jp/ 2026-04-18T15:07:09+00:00 http://sstweb.ee.ous.ac.jp/ http://sstweb.ee.ous.ac.jp/lib/exe/fetch.php?media=wiki:logo.png text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:cyberduck&rev=1661229272&do=diff Cyberduck <http://cyberduck.ch/> What's Cyberduck? FTP, SFTP, WebDAV, などに対応したMacOSX用ソフトウェア。こういうのを一般名称でUser Agentと呼ぶ。 How to use? * Mac側にあるファイルをワークステーションに転送 * ワークステーション側にあるファイルをMacに転送 text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:index&rev=1661229272&do=diff アプリケーション A to Z * TeX関連 * ghostscript * platex * LatexEquationEditor 目的別 * テキストエディタ * FTPclient * プロットソフト * 画像viewer/加工ソフト * 分子描画ソフト A to Z A text/html 2024-03-05T02:26:55+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:jmol&rev=1709605615&do=diff Jmol Download Official site Install jmolのインストール MacOSX版 Jmolはjavaなソフトなので、jmol.jarをダブルクリックすることにより起動するが、ドックに現れるアイコンはjava汎用の味も素っ気も無いものだし、メニューには text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:mi&rev=1661229272&do=diff mi C言語やTeX、html等のソースを書く際に、とても便利な テキストエディタです。 公式サイト <http://www.mimikaki.net/> ダウンロード＆インストール 公式サイトから、バイナリ及び、拡張スクリプトをダウンロードしてくる。 （一つのファイル（ディスクイメージ）に纏められています。） text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:molden&rev=1661229272&do=diff Molden インストール * Linux * rpmやapt-getなど、それぞれのシステムのソフトウェア管理システムを利用してインストールする。 * Mac OS X * finkを用いてインストールする（要X11） text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:rasmol&rev=1661229272&do=diff Rasmol インストール * Linux * rpmやapt-getなど、それぞれのシステムのソフトウェア管理システムを利用してインストールする。 * Mac OS X * finkを用いてインストールする（要X11） text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:vesta&rev=1661229272&do=diff VESTA * VESTAオフィシャルサイト MacOSX版 VESTAは起動時、ホームディレクトリに.VESTA-ユーザ名というlock fileをつくろうとするが、 Mac OS X Server でホームディレクトリを管理していると、これがうまくいかない。現在のところ正攻法を 思いついていないので、以下のようなスクリプトをつくってホームディレクトリを text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:vmd&rev=1661229272&do=diff Visual Molecular Dynamics ダウンロード * オフィシャルサイト インストール $ tar zxvf vmd-1.8.6.bin.LINUX.opengl.tar.gz $ cd vmd-1.8.6/ $ ./configure $ cd src $ sudo make install $ sudo apt-get install tcsh トラブルシューティング $ vmd text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:x11&rev=1661229272&do=diff X11 X11とは X11とはMacOSXの上で、 GUIなUNIXのソフト（gnuplotや、rasmol等）を動かすためのソフトです。 インストール方法 MacOSXインストールの際、 カスタマイズインストールで、 チェックボックスをチェックすると、 インストールできる。 text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:%E5%90%84%E7%A8%AE%E3%82%A2%E3%83%97%E3%83%AA%E3%82%B1%E3%83%BC%E3%82%B7%E3%83%A7%E3%83%B3&rev=1661229272&do=diff 各種アプリケーション よく使用するアプリケーションは、研究室の共有フォルダにおかれています。 インストール作業概要 Multi-Platform VESTA 結晶構造、及び電子・核密度等の三次元可視化プログラム VMD 結晶構造、及び電子・核密度等の三次元可視化プログラム ===== MacOSX ===== text/html 2022-08-23T04:34:32+00:00 Anonymous (anonymous@undisclosed.example.com) http://sstweb.ee.ous.ac.jp/doku.php?id=software:%E7%A0%94%E7%A9%B6%E5%AE%A4%E3%81%AE%E5%85%B1%E6%9C%89%E3%83%95%E3%82%A9%E3%83%AB%E3%83%80&rev=1661229272&do=diff 研究室の共有フォルダ 共有フォルダはsstxの中にある。 新しいソフトウェアをインストールする目的などで共有フォルダにアクセスする場合には、固体理論研究室(sstlab)共通アカウントでログインしているはずなので、 sstxにある共有フォルダはまだマウントされていない。