目次

各種アプリケーション

よく使用するアプリケーションは、研究室の共有フォルダにおかれています。

インストール作業概要

Multi-Platform

VESTA
結晶構造、及び電子・核密度等の三次元可視化プログラム
VMD
結晶構造、及び電子・核密度等の三次元可視化プログラム ===== MacOSX =====
mi
みみかきエディタ。MacOSX用テキストエディタ。
Abscissa
研究室標準2Dグラフ作成ツール。必ず使えるようになること。
Cyberduck
数値計算用ワークステーションとMacとの間のファイル転送を行う。
imol
分子構造可視化ツール。xyzファイルをダブルクリックすると起動する。(起動してしまう)
Plot
2Dグラフ作成ツール。複雑なカーブフィッティングやfftによる処理を行う。

Java

jmol
Javaベースの分子構造可視化ツール。ボンドの組み換えが起こるアニメーションはJmolでつくる。
ImageJ
Javaベースの画像処理ツール。デンシティプロットの仕組みを把握しておくこと。
Samurai Graph
2Dグラフ作成ツール。JavaベースなのでWindowsやLinuxでも使える。

X11

x11
molden
molden
gnuplot
gnuplot
rasmol
rasmol